はてなの仕様の問題だったということらしい

あれ、俺のエントリーがふたつあるよ？
disられてコワイヨーからここまで来てしまいました。どう転ぶか分からないもんですね。

というわけで、あれ、俺のエントリーがふたつあるよ？の疑問に対する答えが出た。
昨日の記事のid:Yuichirouさんとのコメントのやりとりと、id:kkobayashiさんのブクマコメントの話を総合すれば、id:westerndogさんのブクマコメントが答えだということが分かる。
2日の23:30ごろにブクマしたというkkobayashiさん。このとき僕の日記は「日記モード」で動作していたはずだが（僕が日記をブログモードに変更したのは3日の9:15ごろ(寝起きで記憶があいまいだが、2日に変更はしてないはず））、それにもかかわらずkkobayashiさんは「ブログモード」の"記事別ページ"のURLにブックマークしている。そして、kkobayashiさんは「idコールでTBされたURLが"記事別ページ"でした。11:30 PM頃。」と言っている（証拠写真つき）。

結局のところの問題点は、日記モードにしているのにも関わらず、idコール（など？）の機能が動作した場合にはブログモードのURLが呼び出される、ということらしいです。これもはてなの仕様の問題なんでしょうかね。

１つの内容の日記に対して複数のURLのブックマークがあるというのは結構厄介な状況だと思います。ブックマークされる側にとっては、１つの記事について二つのブックマークがあるだなんてそもそも認識できない場合が多いでしょう。ブックマークする側にとっては、人のコメントが見たいと思う場合にはちょっと面倒なことになると思います。注目エントリーや人気エントリーで上がりにくくなったりすることもあるかもしれません。